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活动
3月 24日
蛋白质科学中心电镜系统用户培训通知

蛋白质科学中心电镜系统用户培训通知

 

电镜数据处理软件SCIPION培训班

 

主办单位:国家蛋白质科学中心·上海 (电镜系统)

合办单位:西班牙国家生物技术中心

时间:2016年3月24日(星期四)

地点:上海市浦东新区海科路333号D楼302室

 

 

2016-03-24

SCIPION是西班牙国家生物技术中心Jose-Maria Carazo实验室开发的一款软件,搭建了一个电镜数据处理平台,整合了电镜领域常用的软件,如EMAN,Relion,Xmipp,Spider等。用户可以根据自己的需要,调用不同的软件,来定制电镜数据处理流程。软件主页见 http://scipion.cnb.csic.es/m/home/

 

本次培训由SCIPION开发团队的成员Jose Miguel主讲,分为两部分:

 

09:30-11:30——介绍SCIPION的基本概念,主要功能,使用流程。

- General introduction to Cryo-EM single particles technique.

- Introduction to Scipion framework

             

13:30-17:30——上机操作,现场指导。

- Movies alignment (Xmipp)

- CTF estimation and screening (Ctffind4)

- Particle picking (Xmipp and Eman)

- 2D classification (Spider )

- More picking with templates (Relion)

- 2D classification (Relion and Xmipp, maybe show precomputed results)

- Initial volume methods (Several packages)

- 3D classification and refinement (Relion, maybe show precomputed results)

 

本次培训由上海大科学中心高端用户合作项目资助。

 

上海市浦东新区海科路333号,
电话:021-2077 8500
Email: ncpss@sibcb-ncpss.org